Če so litijeve baterije dlje časa shranjene s popolnoma napolnjenimi ali izpraznjenimi elektrodami, se poškoduje njihova notranja elektrodna struktura. Ko je material pozitivne elektrode popolnoma napolnjen, je nagnjen k sproščanju litijevih dendritov, ki lahko predrejo separator in povzročijo kratek stik; v izpraznjenem stanju (z manj kot 20 % napolnjenosti baterije) bo aktivni material negativne elektrode oksidiral, kar bo pospešilo izgubo zmogljivosti. Pravilen pristop je, da baterijo shranite pri ravni napolnjenosti 50 %-60 %, preden jo odložite. Ta razpon lahko prepreči čezmerne reakcije elektrod in tudi prepreči izgubo moči baterije zaradi samopraznjenja med shranjevanjem. Če za primer vzamemo baterije mobilnih telefonov, jih lahko, če naj ne bodo v uporabi dlje časa, najprej napolnijo do približno 55 %, nato pa izklopijo in shranijo. Kasnejša stopnja ohranjanja zmogljivosti bo več kot 30 % višja kot pri shranjevanju s polno močjo.
Kar zadeva temperaturo, se je treba izogibati ekstremnim okoljem visokih in nizkih temperatur. Idealna temperatura za shranjevanje je 10 stopinj - 25 stopinj. Visoke temperature bodo pospešile razgradnjo elektrolita, nizke temperature pa lahko povzročijo povečanje notranjega upora baterije. Kar zadeva vlažnost, se je treba izogibati vlažnim okoljem, kot so kopalnice in kleti. Baterijo lahko postavite v zaprto vrečko ali -zaboj, odporen na vlago. Po potrebi lahko uporabite sušilno sredstvo, da preprečite, da bi vlaga prodrla v baterijo in povzročila korozijo vmesnika ali kratke stike notranjih komponent. Poleg tega baterija med shranjevanjem ne sme priti v stik s kovinskimi predmeti (kot so ključi in kovanci), da preprečite nenameren kratek stik zaradi nepričakovanega stika pozitivne in negativne elektrode. Prav tako ne stiskajte baterije, da ne poškodujete ohišja, kar lahko privede do puščanja elektrolita.
Tudi ko so v stanju mirovanja, se litijeve baterije še vedno rahlo samo{0}}praznijo. Priporočljivo je, da preverite in napolnite baterijo enkrat na 3 do 6 mesecev: Najprej izmerite napetost baterije (normalna napetost mora biti med 3,6 V in 3,8 V, kar ustreza 50%-60% napolnjenosti baterije). Če je napetost nižja od 3,5 V, je treba uporabiti originalni polnilnik, da ga napolnite do 50%-60% in nato nadaljujete s shranjevanjem; hkrati opazujte videz baterije. Če ugotovite, da je lupina izbočena, deformirana ali pušča, takoj prenehajte s shranjevanjem in z njo pravilno ravnajte. Ne uporabljajte ga več. Pri napravah, kot so prenosni računalniki in napajalniki, je priporočljivo, da če celotna naprava dlje časa ne deluje, jo vklopite in preverite stanje baterije v skladu s tem ciklom, da se izognete čezmernemu praznjenju baterije zaradi porabe energije v ozadju naprave.
